Nors smulkus verslas pasižymi tam tikrais pranašumais, dėl kurių verslininkai ir pasirenka šią veiklos sritį, vis dėlto, reikėtų paminėti ir smulkaus verslo trūkumus.

Pirmas trūkumas yra prastas įmonės valdymas. Tai reiškia, kad dažnai maža įmonė neturi pakankamai lėšų pasamdyti gerus darbuotojus, dėl to atsiranda problemų įmonės valdymo srityje. Tokiu atveju patys vadovai imasi tam tikrų darbų, tačiau jų žinios dažnai gali būti nepakankamos, todėl jų vykdoma veikla yra nekokybiška ir neproduktyvi ypač rinkodaros ir finansų srityse.

Antras trūkumas yra tas, kad bankai dažnai vengia teikti paskolas smulkių įmonių savininkams, nes daug tokių įmonių bankrutuoja ir vėliau yra sunku išieškoti iš jų skolas. Bankai dažnai baiminasi, kai nėra kredito grąžinimo garantijų ir nusprendžia neteikti paskolų. Be to, bankai dažnai išsigąsta ir netinkamai tvarkomos įmonių apskaitos.

Trečias trūkumas yra tas, kad smulkaus verslo įmones dažnai užgožia ir išstumia iš rinkos stambios bei ilgametę patirtį turinčios įmonės. Todėl smulkiai įmonei išlikti rinkoje yra labai sudėtinga. Daug tokių įmonių tiesiog bankrutuoja, nes daugumą klientų vilioja didesnės įmonės, o mažos įmonės lieka nuošaly. Todėl verslininkams prireikia įdėti daug pastangų, kad naujai susikūrusi smulki įmonė atrodytu tinkama paslaugų ar produktų teikėja.

Apibendrinant, galima teigti, kad smulkus verslas pasižymi ir tam tikrais trūkumais. Todėl, prieš imantis įgyvendinti smulkaus verslo idėjas, reikia apsvarstyti visus „už“ ir „prieš“ bei priimti tinkamą sprendimą.